多菌灵灌根时，需要根据农作物种类来调整使用浓度。
如果是用于十字花科蔬菜灌根，一般使用多菌灵600-800倍液。如果是用于瓜类蔬菜灌根，一般使用多菌灵500倍液。
多菌灵用于防治病害时，一般每周喷药一次，连喷2-3次即可。此外，作物成熟前15天以内，不宜喷施多菌灵。
一、多菌灵的灌根方式
1、多菌灵是生活中常见的杀菌性药剂，一般会用这类药剂治疗农作物和果树上的病害，多菌灵灌根配比要根据农作物的品种来确定，有的农作物需要用浓度高的药剂，有的需要用浓度低的药剂。
2、给十字花科蔬菜使用多菌灵时可以按照600:1或800:1的比例用水稀释药剂浇灌土壤，给瓜类蔬菜使用多菌灵时可以按照500:1的比例将药剂稀释水浇灌土壤。多菌灵溶液含有低毒，喷洒药剂要做好防护措施，以防药剂入口。
3、用多菌灵给农作物治疗病害时，通常需要每周喷一次药剂，通常喷2-3次病情就能得到缓解。多菌灵药效非常强，果实和农作物即将成熟的前半个月不可使用多菌灵，这时使用多菌灵后期对人体有一定的危害。
4、而且不能单一的给农作物或果树喷洒多菌灵，刚开始只喷洒一种药剂可以有效的治疗病害，但如果一直喷洒一种药剂，病害会产生抗病性。喷洒多菌灵时尽可能不要将药剂弄到河里，以防河中的小鱼小虾受到毒害。
二、使用多菌灵的注意事项
1、在蔬菜收获前5天停用。本剂不可与强碱性药剂或含铜药剂混用，应与其他药剂轮用。
2、不要长期单一使用多菌灵，也不能与硫菌灵、苯菌灵、甲基硫菌灵等同类药剂轮用。对多菌灵产生抗（药）性的地区，不可采用增加单位面积用药量的方式继续使用，应坚决停用。
3、与硫磺、混合氨基酸铜·锌·锰·镁、代森锰锌、代森铵、福美双、福美锌、五氯硝基苯、丙硫多菌灵、菌核净、溴菌清、乙霉威、井冈霉素等有混配剂；与敌磺钠、代森锰锌、百菌清、武夷菌素等能混用。
4、应在阴凉、干燥处贮存。
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