1、种蛋采集：鸵鸟产蛋后，需要尽快将蛋捡走。捡蛋时需要一个人先将雄鸵鸟引走，然后另外一个人再将蛋捡走。捡蛋时，需要戴好手套，种蛋需用湿毛巾擦干净。
2、种蛋选择：种蛋要求清洁干净，重约1.5kg，外观呈卵圆形、乳白色或米黄色，纵径16-17cm，横径13-14cm。
3、种蛋保存：种蛋保存时应大头朝上垂直或倾斜放置并根据保存时间调整保存温度，相对湿度60%。
一、鸵鸟种蛋的选择
1、种蛋采集
（1）绝大多数雌鸵鸟在下午3-6时产蛋，个别产自上午或夜间。鸵鸟产蛋后要及时捡蛋，以减少破损和污染。雄鸵鸟有保护雌鸵鸟及鸟蛋的本能，捡时要2人搭配，1人将鸟赶开，1人把蛋捡走。
（2）捡蛋时应将手洗净或戴手套，以免污染种蛋。对污染的种蛋用消毒湿毛巾擦干净。种蛋须登记，注明雌、雄种鸟号码和产蛋日期，并称重编号。
2、种蛋选择
（1）合格的种蛋要求清洁，表面不应有泥土、粪便以及其他污物。其二要求大小适中，蛋重过大过小都会影响孵化率和雏鸟的质量，通常要求种蛋重1.5千克左右，超过2千克和小于1千克的种蛋一般应淘汰。
（2）第三要求种蛋的外形呈卵圆形，纵径16-17厘米，横径13-14厘米，过长、过圆、扁形及畸形蛋孵化率低。种蛋的颜色通常为乳白色或米黄色。洁白色的蛋孵化率较低。
3、种蛋保存
种蛋贮存时应大头朝上垂直或倾斜放置，时间以3-5天为宜，如果贮存期不超过7天，可不翻蛋。若种蛋贮存不超过4天，保存温度以16-18℃为宜。超过4天应为13℃左右。相对湿度为60%。
二、孵化前消毒准备
1、鸵鸟蛋贮藏室的消毒：
每2天用消毒液擦地板1次，隔2周全部清洗、消毒，并用福尔马林溶液进行熏蒸。
2、种蛋的消毒：
（1）鸵鸟产蛋时，饲养员要用消毒纱布接住，然后送孵化室消毒，消毒剂量每平方米用37%的福尔马林42毫升，高锰酸钾21克，熏蒸30分钟。
（2）如果没有接住，用经消毒液浸泡的纱布擦去表面赃物，马上送孵化室消毒。入孵之前，用消毒药（温度不要超过40℃）浸泡20-30秒，然后用消毒过的干纱布擦干种蛋即可入孵。
3、孵化室的消毒：
孵化室地板每隔2天用消毒药拖擦1次，墙壁、天花板每隔半个月用消毒药喷洒1次，1个月进行全面清扫1次
4、孵化机的消毒：
每次孵化之前，孵化机内外及表面用消毒药擦拭一遍，并用福尔马林熏蒸消毒。
三、孵化期管理技术
1、孵化温、湿度控制
鸵鸟孵化期为42天，孵化中前期温度恒定在36．8℃，孵化后期30-42天，胚胎自身产生大量的热，需要的温度相对较低，以36℃为宜。
2、照蛋
（1）照蛋的目的是观察胚胎发育程度和异常情况，及时剔除无精蛋和死胚蛋。首次照蛋是在入孵时进行，检查种蛋放入蛋盘时气室是否朝上。
（2）第二次照蛋是在入孵的第十二天，此时鸵鸟的喙和喙尖开始形成，腿和翅膀大致分化，尿囊膜扩展到蛋壳膜内表面，胚胎的躯干部增大，照蛋时可见到清晰的血管，能见到头部和躯干部2个小圆团，称为“双珠”。
3、翻蛋
（1）鸵鸟蛋黄含脂肪多，比重较轻，浮在蛋的中间由系带系着，胚胎吸收养分，排除废物。如果长时间处于一种位置，蛋黄不可维系在蛋的中央，容易与蛋壳的内膜粘连。
（2）翻蛋的目的在于使胚胎外部空间定位，同时也避免粘连，促进羊膜运动。鸵鸟蛋孵化期内通常每2小时翻蛋1次，40天转入出雏器后停止翻蛋。
（3）一般孵化器设计的翻蛋角度为前俯后仰各45度，据研究，如果翻蛋角度增大到50-55度，会促进胚胎发育和血液循环，使孵化率有所提高。
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