复合碘主要用作消毒剂，可以用于浸泡鱼卵或给器具消毒，其可以抑制、灭杀细菌、病毒、霉菌、原生动物、芽孢、孢子虫、线虫等。
复合碘可以使用于无鳞鱼身上，因为无鳞鱼对消毒药极为敏感，因此需要使用比较温和的药物。除此之外，复合碘还可以用于治疗细菌性或病毒性疾病。
一、复合碘在水产养殖有什么作用
1、复合碘是非常好的浸泡消毒药品，主要是作为消毒剂使用，复合碘可以浸泡鱼卵，给器具消毒，很多时候都可以使用复合碘，由于复合碘中含有的碘元素活性非常强，对细菌、病毒、霉菌、原生动物、芽孢、孢子虫、线虫均有抑制和杀灭的作用。
2、复合碘还可以使用在无鳞鱼身上，因为无鳞鱼对许多消毒药具有非常强的敏感性，比如江团、斑点叉尾鮰等，因此要使用比较温和的药物。
3、复合碘还可以用于治疗细菌性或病毒性疾病，在这方面复合碘有很独等的疗效，比如一些顽固性的烂鳃，只要坚持使用复合碘半个月就会得到非常好的控制，但是在使用时需要注意碘的浓度要低于50ppm，否则对鱼类有毒，而且清洗过器具的消毒水应防止直接倒入养殖鱼塘。
二、复合碘有哪些优缺点
1、优点
（1）复合碘的杀菌效果比较好，易溶于水也不会脱碘，性能比较多稳定，有效浓度低不会刺激皮肤和黏膜等优良性能。
（2）复合碘可以安全用于水生生物细菌性疾病和病毒性疾病的防治，而且复合碘没有刺激性，因此它可以用于鱼卵的药浴消毒和苗种浸浴。
2、缺点
（1）复合碘不可杀灭芽胞等一些比较顽固的细菌，由于这些复合碘对这些细菌并没有非常大的效果，而且复合碘还比较容易对光敏感，易受有机物干扰。
（2）复合碘不可用在冷水鱼等对碘敏感的鱼身上，否则可能会由于使用不当而导致大量的鱼出现死亡现象，使用时也要注意检查鱼是否对复合碘过敏。
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