挑选草菇菌种时，以透明状，银灰色，分布均匀，菌丝稀疏，有红褐色厚垣孢子者为宜。
若菌丝间混杂有洁白线状菌丝，随之出现鱼状颗粒，久而久之变成黄棕色，应淘汰。
若菌丝过于密集，洁白，应淘汰。
若菌丝出现螨食斑块，菌丝逐渐消失，应淘汰。
若菌丝萎缩，散发腥臭味，出现水渍状液体，应淘汰。
若菌龄超过30天，应淘汰。
一、如何挑选草菇菌种
1、优良的草菇菌种，以草料培养基制种过冬(10-15℃)，越冬之后，提前栽培证明是优质高产者，再用组织分离法得到母种(级种)，继续扩大培养，供应当年生产使用。
2、草菇菌丝为透明状，银灰色，分布均匀，菌丝较为稀，有红褐色的厚垣孢子为正常的菌种。如厚垣孢子较多，通常来说，出菇后子实体较小，反之子实体较大。
3、若银灰色草菇菌丝间掺杂有洁白线状菌丝，随后出现鱼状颗粒，久之成黄棕色，则可能混有小菌核杂菌，若瓶内菌丝过浓密、洁白，也可能是混有杂菌，都应淘汰。
4、如果菌瓶内菌丝逐渐消失，出现螨食斑块，说明染有螨虫，应淘汰。瓶内菌丝已萎缩，出现水渍状液体，有腥臭味者也不可使用。
5、草菇栽培种的菌龄以18天左右为宜，超过30天的最好不要选择。
二、草菇的栽培方式
1、整畦
草菇栽培畦为南北向，宽度1米，长度视棚宽而定，畦深为8～10厘米，畦间距为30～50厘米，挖畦的土暂放在畦埂上。
2、铺料
浸泡好的培养料在畦内铺成龟背形，也可铺成波浪形，料垄厚15厘米，两边料厚5～8厘米，用料15～20千克/平方米。
3、播种
把培养好的菌种掰成1～2厘米见方小块，采用穴播的方法，穴间距8～10厘米，把菌种均匀播入1厘米深的料中，每穴播菌种10～15克，然后把畦埂上的土覆在培养料上。
4、覆土
覆土不能用黏土和沙土，不可过干过湿，覆土厚度比料垄厚1厘米、料沟厚3～5厘米，然后用直径2厘米消过毒的木棍打眼通气，眼间距10厘米，打眼深度以打通料为宜。
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