该品种属籼型三系杂交水稻。
育秧：适时早播，每亩用种量0千克，采取湿润地膜育秧或两段育秧，稀播，培育多蘖壮秧。
移栽：中苗移栽，宽行窄株规格，每亩栽插3万~5万穴，每穴栽插2粒谷苗，基本苗达到9万~10万苗。
该品种符合国家稻品种审定标准，通过审定。熟期适中，产量中等，中感稻瘟病，高感褐飞虱，米质优。适宜在云南、贵州、重庆的中低海拔籼稻区（武陵山区除外）、四川平坝丘陵稻区、陕西南部稻区作一季中稻种植。
一、内5优5399水稻品种基本信息
1、审定编号：国审稻2009005。
2、作物名称：水稻。
3、品种名称：内5优5399。
4、申请者：内江杂交水稻科技开发中心。
5、育种者：内江杂交水稻科技开发中心。
6、品种来源：内香5A×内恢3399。
7、审定意见：该品种符合国家稻品种审定标准，通过审定。熟期适中，产量中等，中感稻瘟病，高感褐飞虱，米质优。适宜在云南、贵州、重庆的中低海拔籼稻区（武陵山区除外）、四川平坝丘陵稻区、陕西南部稻区作一季中稻种植。
二、特征特性
1、该品种属籼型三系杂交水稻。
2、在长江上游作一季中稻种植，全生育期平均155.6天，比对照Ⅱ优838短1.6天。
3、株型适中，茎秆粗壮，叶片宽大直立，熟期转色好，叶鞘、叶缘、颖尖、茎节均为紫色，穗顶部少量谷粒有短芒，每亩有效穗数16.0万穗，株高113.2厘米，穗长24.6厘米，每穗总粒数170.9粒，结实率80.1%，千粒重29.0克。
4、抗性：稻瘟病综合指数3.8级，穗瘟损失率最高5级。
5、褐飞虱9级。
6、抽穗期耐热性中等，对低温敏感。
7、米质主要指标：整精米率61.1%，长宽比3.1，垩白粒率22%，垩白度2.6%，胶稠度67毫米，直链淀粉含量22.9%，达到国家《优质稻谷》标准2级。
三、栽培技术要点
1、育秧：适时早播，每亩用种量0千克，采取湿润地膜育秧或两段育秧，稀播，培育多蘖壮秧。
2、移栽：中苗移栽，宽行窄株规格，每亩栽插3万~5万穴，每穴栽插2粒谷苗，基本苗达到9万~10万苗。
3、肥水管理：施肥宜重底早追，多施用有机肥，注意氮、磷、钾肥合理搭配，切忌偏施氮肥，超高产栽培适当增施磷、钾肥。
4、特别注意后期水肥管理，忌脱水过早。
5、病虫防治：注意及时防治螟虫、稻瘟病、稻飞虱等病虫害。
四、产量表现
1、2007年参加长江上游迟熟中籼组品种区域试验，平均亩产589.63千克，比对照Ⅱ优838增产0.17%(不显著)。
2、2008年续试，平均亩产610.22千克，比对照Ⅱ优838增产0.84%(不显著)。
3、两年区域试验平均亩产599.92千克，比对照Ⅱ优838增产0.51%，增产点比例61.5%。
4、2008年生产试验，平均亩产587.90千克，比对照Ⅱ优838增产5.00%。
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