小麦常见病害有锈病、白粉病、赤霉病、霜霉病、炭疽病等。
锈病：主要危害叶片，可用三唑酮+百菌清进行防治，亦可使用丙环唑、氟环唑防治。
白粉病：主要危害叶片，发病前期选用三唑酮、氟菌唑防治，发生普遍时选用烯唑醇、腈菌酮防治。
赤霉病：主要危害小麦穗部，发生时选用烯唑醇、丙环唑防治。
霜霉病：发病后使用硫酸铜、甲霜灵·锰锌、霜霉威防治。
一、小麦锈病
1、主要是条锈病，主要危害小麦的叶片，造成小麦叶片提前干枯。多发生在小麦抽穗至灌浆期。严重影响小麦籽粒灌浆，是造成小麦减产最严重的病害。
2、防治方法：种植抗病品种为主，锈病发生时，南方多雨麦区要开沟排水；北方干旱麦区做好灌水，返青拔节期后发现中心病株，应及时用杀菌剂防治：三唑酮+百菌清，丙环唑或氟环唑，对水均匀喷雾，间隔8-10天，连喷2次。
二、小麦白粉病
1、主要为害叶片，严重时会危害叶鞘、茎秆等，初期症状为黄色小点，后期扩大为圆形或椭圆形病斑，表面有白粉状霉层，先是白色，后为浅褐色，其上生有许多黑色小点。
2、防治方法：发病前期可用药剂三唑酮，氟菌唑。发生较普遍时，用烯唑醇，腈菌酮或烯肟菌胺，对水均匀喷雾。
三、小麦赤霉病
1、是小麦穗部最严重的病害，该病具有传播速度快，防治困难，减产严重等特点。主要危害小麦的颖壳和籽粒，造成颖壳腐烂，籽粒变质，失去食用价值，严重影响小麦的产量和品质。
2、防治方法：追肥不可过晚，病害发生可用烯唑醇或丙环唑，对水喷雾。
四、小麦霜霉病
1、返青拔节后染病后叶色变浅，出现黄白条形花纹，叶片变厚，不能以正常抽穗，或者是叶鞘抽出，病株的茎秆粗壮，表面有白霜状霉层。
2、防治方法：播前可以用25%甲霜灵可湿性粉剂拌种，必要时在播种出苗后，喷洒硫酸铜、甲霜灵·锰锌、霜霉威等进行防治。
五、小麦炭疽病
1、主要为害叶鞘和叶片，叶鞘染病：麦株基部叶鞘先发病，初期会出现褐色病变，出现1-2cm长椭圆形病斑，边缘暗褐色，中间灰褐色。叶片染病：形成近圆形至椭圆形病斑。后期病部连成一片，致叶片早枯。
2、防治方法：与非禾本科作物进行3年以上轮作，发病重的地区或地块，可喷洒咪鲜胺锰盐，苯菌灵或者是多菌灵，间隔10-15天再喷1次，连喷2-3次。
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